Health

Bagaimana Mutasi Varian Alpha Mengatasi Titik Lemahnya

GAYATREND.com – Salah satu mutasi kunci yang terlihat pada SARS-CoV-2 ‘varian Alpha’ – yakni penghapusan dua asam amino, H69/V70 – memungkinkan virus mengatasi celah pada pelindungnya saat berkembang, kata tim ilmuwan internasional.

SARS-CoV-2 adalah virus corona, dinamakan demikian karena protein lonjakan pada permukaannya memberikan tampilan seperti mahkota (‘corona’). Protein lonjakan mengikat ACE2, reseptor protein yang ditemukan di permukaan sel dalam tubuh kita. Baik protein lonjakan dan ACE2 kemudian dibelah, memungkinkan materi genetik virus memasuki sel inang. Virus memanipulasi mesin sel inang untuk memungkinkan virus bereplikasi dan menyebar.

Saat SARS-CoV-2 membelah dan bereplikasi, kesalahan dalam susunan genetiknya menyebabkannya bermutasi. Beberapa mutasi membuat virus lebih menular, beberapa membantu menghindari respon imun, berpotensi membuat vaksin kurang efektif, sementara yang lain memiliki sedikit efek, seperti dikutip dari University of Cambridge, Kamis (1/7/2021).

Menjelang akhir tahun 2020, para ilmuwan Cambridge mengamati SARS-CoV-2 bermutasi dalam kasus pasien immunocompromised yang diobati dengan plasma konvalesen. Secara khusus, mereka melihat munculnya mutasi kunci – penghapusan dua asam amino, H69/V70, dalam protein lonjakan. Penghapusan ini kemudian ditemukan di B1.1.7, varian yang menyebabkan Inggris dipaksa sekali lagi melakukan penguncian ketat pada bulan Desember (sekarang disebut sebagai ‘varian Alpha’).

Sekarang, dalam penelitian yang diterbitkan dalam jurnal Cell Reports, para peneliti menunjukkan bahwa penghapusan H69/V70 muncul di lebih dari 600.000 sekuens genom SARS-CoV-2 di seluruh dunia, dan telah mengalami ekspansi global, terutama di sebagian besar Eropa, Afrika, dan Asia.

Penelitian ini dipimpin oleh para ilmuwan di University of Cambridge, MRC-University of Glasgow Center for Virus Research, The Pirbright Institute, MRC Laboratory of Molecular Biology, dan Vir Biotechnology.

Profesor Ravi Gupta dari Cambridge Institute of Therapeutic Immunology and Infectious Disease di University of Cambridge, penulis senior studi tersebut, mengatakan, “Meskipun kami pertama kali melihat mutasi ini pada pasien immunocompromised dan kemudian pada varian Kent – sekarang ‘Alpha’, ketika kami melihat sampel dari seluruh dunia, kami melihat bahwa mutasi ini telah terjadi dan menyebar berkali-kali secara independen.”

Bekerja di bawah kondisi yang aman, Profesor Gupta dan rekan menggunakan ‘virus palsu’ – virus tidak berbahaya yang menampilkan protein lonjakan SARS-CoV-2 dengan penghapusan H69/V70 – untuk memahami bagaimana protein lonjakan berinteraksi dengan sel inang dan apa yang membuat mutasi ini sangat penting.

Ketika mereka menguji virus ini terhadap serum darah yang diambil dari lima belas orang yang telah pulih dari infeksi, mereka menemukan bahwa penghapusan tidak memungkinkan virus itu ‘melarikan diri’ dari antibodi penetral yang dibuat setelah divaksinasi atau setelah infeksi sebelumnya. Sebaliknya, tim menemukan bahwa penghapusan membuat virus dua kali lebih infektif – yaitu, membobol sel inang – sebagai virus yang mendominasi infeksi global selama paruh kedua tahun 2020. Ini karena partikel virus yang membawa penghapusan memiliki jumlah protein lonjakan matang yang lebih banyak di permukaannya. Hal ini memungkinkan virus untuk bereplikasi secara efisien bahkan ketika memiliki mutasi lain yang mungkin menghambat virus.

“Ketika virus bereplikasi, mutasi apa pun yang mereka peroleh dapat bertindak sebagai pedang bermata dua: mutasi yang memungkinkan virus menghindari sistem kekebalan, misalnya, dapat memengaruhi seberapa baik ia dapat bereplikasi,” kata Profesor Gupta.

“Apa yang kami lihat dengan penghapusan H69/V70 adalah bahwa dalam beberapa kasus, penghapusan membantu virus mengompensasi efek negatif yang datang dengan mutasi lain yang memungkinkan virus lolos dari respons imun. Dengan kata lain, penghapusan memungkinkan varian ini mendapatkan kue dan memakannya – mereka berdua lebih baik dalam menghindari kekebalan dan lebih menular.”

Dr Dalan Bailey dari The Pirbright Institute, yang ikut memimpin penelitian, menambahkan, “Dalam istilah evolusi, ketika virus mengembangkan kelemahan, itu dapat menyebabkan kematiannya, tetapi penghapusan H69/V70 berarti bahwa virus dapat bermutasi lebih jauh dari yang seharusnya. Ini mungkin menjelaskan mengapa penghapusan ini sekarang begitu meluas.”

Bo Meng dari Departemen Kedokteran di Universitas Cambridge, penulis pertama makalah tersebut, mengatakan, “Memahami pentingnya mutasi kunci penting karena memungkinkan kita untuk memprediksi bagaimana varian baru mungkin berperilaku pada manusia ketika pertama kali diidentifikasi. Ini berarti kita dapat menerapkan strategi kesehatan dan penahanan masyarakat sejak dini.”

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *